注册处是负责处理申请入读新加坡神学院手续的部门。当申请者呈交填妥的申请表格，以及院方要求的附加文件后，院方才会正式处理其申请。

学院评估申请者的标准包括︰性格、全职事奉的意愿、学历、语文能力、音乐程度（圣乐系申请者）、工作与事奉经验、所属教会的称许、推荐人的评估、与本院信仰的认同、属灵的恩赐、事奉潜能、年龄和健康状况等。